Mais de trinta novas espécies de bactérias descobertas em amostras de pacientes
Germes desconhecidos são uma ocorrência comum em hospitais. Pesquisadores da Universidade de Basileia passaram muitos anos coletando e analisando-os. Eles identificaram muitas novas espécies de bactérias, algumas das quais são significativas para a prática clínica.
As infecções bacterianas podem ser tratadas com mais eficiência se a causa da doença for conhecida. Na maioria dos casos, para identificar um patógeno, basta uma análise em um laboratório médico. Às vezes, porém, os métodos padrão são insuficientes – por exemplo, se a espécie de bactéria ainda não tiver sido classificada ou for particularmente difícil de cultivar.
Uma equipe da Universidade de Basileia e do Hospital Universitário de Basileia vem coletando e analisando amostras de pacientes contendo esses germes desconhecidos desde 2014. Os pesquisadores descobriram mais de trinta novas espécies de bactérias, algumas das quais estão associadas a infecções clinicamente relevantes.
Análise genética completa
No geral, a equipe liderada pelo microbiologista Dr. Daniel Goldenberger analisou 61 patógenos bacterianos desconhecidos encontrados em amostras de sangue ou tecidos de pacientes com uma ampla gama de condições médicas. Os métodos laboratoriais convencionais, como a espectroscopia de massa ou a sequenciação de uma pequena parte do genoma bacteriano, não conseguiram produzir resultados para todos estes isolados. É por isso que os pesquisadores sequenciaram o material genético completo da bactéria usando um método que só está disponível há alguns anos. Eles então compararam as sequências do genoma identificadas com cepas conhecidas em uma ferramenta online.
Das 61 bactérias analisadas, 35 eram até então desconhecidas. Os investigadores classificaram as restantes 26 estirpes como difíceis de identificar: ou as suas sequências genómicas só tinham sido adicionadas recentemente às bases de dados ou uma descrição taxonómica correta dos agentes patogénicos só tinha sido criada há muito pouco tempo. Uma avaliação dos dados dos pacientes mostrou que sete das 35 novas estirpes eram clinicamente relevantes, o que significa que podem causar infecções bacterianas em humanos. “Essas ligações diretas entre espécies de bactérias recentemente identificadas e sua relevância clínica raramente foram publicadas no passado”, disse o Dr. Goldenberger.
Causa de infecções raras
A maioria das espécies recém-identificadas pertence ao Corinebactéria e Schaalia gêneros, ambos bacilos gram-positivos. “Muitas espécies desses dois gêneros são encontradas no microbioma natural da pele humana e na mucosa. É por isso que são frequentemente subestimadas e a pesquisa sobre elas é escassa”, explicou o Dr. Eles podem, no entanto, causar infecções quando entram na corrente sanguínea – devido a um tumor, por exemplo.
Um dos patógenos difíceis de identificar também pode ser clinicamente relevante. Foi encontrado no polegar inflamado de um paciente após uma mordida de cachorro. Um grupo de pesquisa canadense também isolou recentemente esta bactéria de feridas causadas por mordidas de cães ou gatos. “Isso nos levou a supor que se trata de um patógeno emergente que precisamos monitorar”, disse o Dr. Goldenberger. Os pesquisadores canadenses nomearam apropriadamente a bactéria Vandammella animalimorsus (mordida de animal Vandammella) em 2022.
Nomear suas novas espécies também é o próximo item da lista de tarefas da equipe da Basileia. Eles estão trabalhando em estreita colaboração com o professor Peter Vandamme, da Universidade de Ghent, especialista em classificação de bactérias. Duas das bactérias já foram nomeadas. Um é Pseudoclavibacter triregionum – referindo-se à localização de Basileia perto das fronteiras da Suíça, França e Alemanha.
Contudo, o projeto iniciado pela equipe de Daniel Goldenberger está longe de estar concluído. Os pesquisadores continuam a coletar e sequenciar sistematicamente patógenos desconhecidos encontrados em amostras de pacientes do Hospital Universitário de Basileia – outras vinte novas espécies já foram detectadas. “Notamos uma grande dinâmica aqui: graças aos avanços tecnológicos em bacteriologia, muito mais está sendo publicado sobre espécies de bactérias recentemente descobertas”, explicou o Dr. Goldenberger. Este desenvolvimento tornará mais fácil, no futuro, diagnosticar correctamente infecções causadas por agentes patogénicos raros e tratá-las eficazmente desde o início.
Publicação original
Veronika Muigg et al.
Estudo de Verificação e Análise de Novos Organismos (NOVA): identificação de 35 isolados clínicos representando táxons bacterianos potencialmente novos usando um pipeline baseado no sequenciamento do genoma completo
Microbiologia BMC (2024), doi: 10.1186/s12866'023 -03163-7
